新疆长绒棉和普通棉的区别如下：

形态特征不同：长绒棉品质优良，其纤维柔长，为33～39毫米，最长可达64毫米；细度为7000～8500米/克，宽度15～16微米；强度较高，为4～5克力/根，断裂长度33～40千米；转曲较多，为80～120个/厘米。普通棉花纤维为白色或白中带黄，长2至4厘米，含纤维素87%～90%，水5%～8%，其他物质4%～6%。

产地不同：新疆长绒棉，产于新疆吐鲁番盆地、塔里木盆地的阿克苏、巴音郭楞、喀什等到地，为我国长绒棉产区。普通棉花种植国家有中国、美国、印度、乌兹别克斯坦、埃及等。其中中国产区为江淮平原、江汉平原、南疆棉区、华北平原、鲁西北、豫北平原、长江下游滨海沿江平原。

用途不同：长绒棉主要用来纺制高支纱。高支纱一般用于纺织高档面料与特殊用布。普通棉花是世界上最主要的农作物之一，产量大、生产成本低，这样的条件使得棉织品价格比较低廉。

价格不同：长绒棉的价格高于普通棉

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